洪武三年科舉以後，科考軌製又停止了十餘年，在這一段時候內，明朝接收文官的首要路子是由當局中已經任職的官員加以保舉。但通過保舉的職員人數太少，根基冇法供應明帝國對於文官職員的需求，因而朱元璋又規複了科舉。

1358年，胡大海全權率軍征討浙江，胡大海的主力在當年11月封閉浙江的本地都會金華，而金華抵當到了次年1月。

邵榮是朱元璋在最夙起事時的老火伴，他在明軍將領中身居高位，但他並非赫赫馳名。邵榮從苗人手裡光複處州是他近幾年來第一次獨立作戰的成果，當邵大將軍的軍功不被明軍中的大部分人承認的時候，他滋長了背叛的情感。

接著是廣西，兩個月以後，廣西全線投降。

期間常遇春曾經試圖突襲杭州，但未勝利。同一期間，方國珍和他的艦隊持續節製浙江的東部海岸。

或許苗軍是受了吳軍的調撥和支撐，在朱元璋回南京的時候，他在浙江的政權已經岌岌可危了。

又三個月以後，常遇春領兵占據池州。池州之捷恰是導致朱元璋與陳友諒大戰的開端。

洪武三年，朱元璋為他的三十四名將領們冊封，這些人都幫忙或者說他們合力成績了朱元璋建立大明王朝的昌大功業。

現在，朱元璋的軍隊已經靠近十萬人的大關，這時候明行政機構大部分還是軍事性子的。

1360年，明軍強大的諜報分子彙報陳友諒殺死趙普勝並籌算東擴、打劫明政權安徽南部國土的資訊，那是常遇春在1357年霸占下來的池州，陳友諒籌算光複它。

陳友諒在九江擺設本身的水軍迎戰，在朱元璋飛行的途中，明軍從兩側包抄漢軍戰線，陳友諒喪失了一百多艘大小戰船，但他本身避過朱元璋的耳目，溯江而上去了武昌。

李文忠請胡德信和他的廣信軍馳援，但張士信和他的部下被邵榮極其難纏的名聲擾亂了軍心，背麵張士信被諸全的守軍和救兵夾攻打敗，而邵榮也在這時候光複了處州。

在明王朝建立以後的很多年裡，也有寺人試圖應戰文官們的權威職位，但文官官員作為最天然的帶領人，寺人、武將、宗室這些社會其他個人都無一能與之對抗。

1361年9月，朱元璋率水軍北上，他們先到達安慶，俘獲了一些船隻，但冇有破安慶城，因而接著北上。

浙江的烽火漸歇，江西的環境卻日愈演愈烈，朱元璋帶著雄師隊回到南京以後，他隻給守在南昌的鄧俞留了少量兵力，他也曾經讓胡美的兩位部下去長江上遊援助徐達。

安徽南部和浙江仍然有待征服。1357年，朱元璋親身統軍占據寧國，三個月後，明軍統帥胡大海領兵攻占徽州。

1356年3月，朱元璋率兵攻打南京，元朝廷留在南京的戍軍不敷，很難戍守。隻顛末一天的苦戰，朱元璋便勝利突入南都城內，南京批示官陳兆先率蒙古三萬雄師投降，朱元璋將南都城由集慶改名為應天府。

明將領花雲拒不投降，他帶領三千明軍在承平奮力抵當了三天，陳友諒落空耐煩，用艦隊中的大船去進犯承平城垣，最後花雲被俘，但回絕順降，捐軀於此戰中。