秦穆公二十五年（前635年），周襄王派人向晉國、秦國通報產生禍亂的環境。春季，秦穆公領兵駐紮在黃河邊上，籌辦護送天子回朝。晉文公聽到狐偃的建議後讓卜偃占卜。按照占卜成果，晉文公遁推讓秦穆公退兵，本身則帶兵順黃河而下，護送周襄王回朝，並殺死王子帶。春季，秦穆公和晉文公出兵攻打鄀國，楚國的鬥克、屈禦寇帶領申縣、息縣軍隊保衛商密（在今河南淅川一帶）。秦軍顛末析邑（今河南內鄉一帶），將本身的兵士捆起來假裝俘虜，包抄了商密，傍晚時逼近城下。夜裡掘地殺牲，把盟書放在上麵，假裝成和鬥克、屈禦寇歃血盟誓的模樣。商密人驚駭了，說：“秦國人已占據析地了，戍守的鬥克、屈禦寇叛變了我們！”因而投降了秦軍。秦軍將申公鬥克、息公屈禦寇囚禁返國。

秦穆公十四年（前646年），秦國產生了饑荒，秦穆公向晉國借糧食。晉惠公與群臣商討，虢射說：“趁秦國饑荒而攻打秦國，能夠獲得大勝利。”晉惠公服從了虢射的建議，不給秦國供應糧食。

秦穆公二十二年（前638年），晉惠公得病，太子圉得知後說：“梁國事我母親的故鄉，秦國卻滅了它。我兄弟浩繁，晉惠公百年後，秦國必然留住我，晉國也不會正視我，而改立晉惠公的其他公子。”並與老婆謀齊截起逃回晉國。其妻不肯跟班，因而太子圉逃回晉國。次年（晉惠公十四年，前637年）玄月，晉惠公歸天，太子圉即位為君，史稱“晉懷公”。秦穆公對晉懷公的逃離非常憤恨，就從楚國迎來晉國公子重耳，並把本來晉懷公的老婆嫁給公子重耳。公子重耳開端時回絕，厥後就接管了。秦穆公對公子重耳更加以禮寵遇。

秦穆公十年（前650年）四月，周公忌父、王子黨彙合隰朋立公子夷吾為晉侯，史稱“晉惠公”。晉惠公殺了裡克，並派丕鄭感激秦國，背棄信約，不把河西八城給秦國。丕鄭聽到這個動靜後感到驚駭，因而與秦穆公籌議說：“晉國人並不想要晉惠公，實在想要公子重耳。現在晉惠公背棄信約並且殺死裡克，都是呂甥、卻芮的主張。但願您用利誘的體例從速召來呂甥、卻芮，二人一來，那麼再護送公子重耳回晉國就輕易了。”秦穆公采取了他的建議。夏季，秦穆公派泠至與丕鄭回晉國，召呂甥、卻芮。呂甥、卻芮等人思疑丕鄭有詭計，便建議晉惠公殺了丕鄭、祁舉及二人的翅膀七輿大夫。丕鄭的兒子丕豹逃到秦國，勸秦穆公說：“晉國國君無道，百姓叛離，能夠借這個機遇去攻打晉國。如果討伐他，百姓必定會趕他走。”秦穆公說：“如果夷吾落空百姓，如何還能殺掉大臣？晉國的百姓如果都像你一樣紛繁逃離禍難，還如何能趕走國君呢？”冇有采取了他的建議，但暗中重用他。

秦穆公九年（前651年）玄月，晉獻公歸天，驪姬的兒子奚齊繼位。十月，晉國臣子裡克在居喪的房屋中殺死奚齊，荀息擁立卓子。十一月，裡克又在朝堂上殺死卓子，荀息隨之他殺。公子夷吾在卻芮的建議下派人要求秦國幫忙他回到晉國，秦穆公應允後派百裡奚帶兵護送公子夷吾返國。公子夷吾對秦國人說：“如果我能成為晉國國君，願割讓晉國的河西八城給秦國。”齊國的隰朋帶領軍隊彙合秦軍，送夷吾返國。