孫策轉而揮師攻打秣陵城（今江蘇省南京市）的薛禮，薛禮突圍逃脫。這時樊能、於麋等人，又糾集兵士來奪牛渚。孫策當即回軍，打敗他們，俘獲男女萬餘人。然後再次打擊笮融。在與笮融的戰役中，孫策腿部中箭，冇法乘馬，部下抬他回營療傷。[45] 在孫策受傷之時，曾經投降的“男女萬餘人”趁機背叛，孫策的孃舅吳景率軍攻討背叛者，將背叛者們全數擒獲。[46]

孫策見笮融負險恪守，一時難以霸占，便引兵南向，先在梅陵（今安徽省南陵縣）擊敗劉繇的彆部，接著轉兵霸占湖孰（今江蘇省江寧縣南湖熟鎮）、江乘（今江蘇省句容縣）等地。然後清算軍隊，到曲阿與劉繇決鬥。[

一統江東

建安四年（199年），袁術病死，其部下為廬江太守劉勳獲得，劉勳的兵力突然大增。因而孫策以寒微的言辭和財寶勸說劉勳攻取上繚。因而，劉勳悄悄率軍顛末彭澤，來到海昏處所。本地守將堅壁清野，留下一座空城，劉勳一無所獲。劉勳又轉而打擊上繚。

郭嘉：策新並江東，所誅皆英豪雄傑，能得人死力者也。然策輕而無備，雖有百萬之眾，無異於獨行中原也。若刺客伏起，一人之敵耳。以吾觀之，必死於匹夫之手。[59]

汗青評價

許貢：孫策驍雄，與項籍類似，宜加貴寵，派遣京邑。若被詔不得不還，若放於外必作世患。[57]

十仲春八日，孫策進至黃祖屯兵的沙羨（今湖北省嘉魚縣）。劉表派侄兒劉虎和南陽人韓曦帶領長矛隊五千人趕來援助黃祖。十一日，孫策帶領周瑜、呂範、程普、孫權、韓當、黃蓋劃一時打擊黃祖軍，最後黃祖單身逃脫，其妻妾後代共七人被孫策抓獲，劉虎、韓曦並兩萬餘部重被殺，跳水滅頂者達一萬餘人，孫策緝獲船隻六千餘艘，財物堆積如山。

建安三年（198年），孫策又向漢廷進獻禮品。漢廷任命他為討逆將軍，封為吳侯。孫策是以在言論上獲得漢當局的承認。[54]

分裂袁術

初平三年（192年[102] ），孫堅被殺，孫策舉家遷到江都。在江都期間，孫策數次拜訪揚州名流張紘，和他研討天下局勢。並說出了其安身江東的策劃，第一步從袁術手中索要其父孫堅的軍隊，然後渡江南下尋求其母舅丹陽太守吳景的支撐，以丹陽為按照地招募軍隊，占據吳、會稽等郡，進而討伐劉表、黃祖，為其父孫堅報仇，最後建立孫吳政權。該策劃獲得了張紘的認同，並在張紘的彌補完美下，成為孫吳政權建立和生長的既定戰略[122] 。[54]

這時，袁術之前任命的周瑜為居巢長，魯肅為東郡長，但二人知袁術難成大器，在孫策安定丹陽時接踵棄官渡江來投奔孫策，孫策親往驅逐周瑜，拜建威中郎將，當即給周瑜增兵二千人，馬五十匹。又給周瑜鼓吹等軍用樂隊，興建府院住處，所贈賜的東西在軍中無人能比。[30] 同年，孫策又向漢廷進獻禮品，範圍是建安元年的兩倍。漢廷任命他為討逆將軍，封為吳侯。

袁術：使術有子如孫郎，死複何恨？[

劉繇與孫策交兵，遭到慘敗，逃往丹徒（今江蘇省鎮江市），孫策入據曲阿（拜見曲阿之戰）。[49] 孫策雄師所到之處，軍士們嚴遵將令，不擄掠百姓，雞犬菜茹，秋毫無犯。因而，百姓非常高興，爭著用牛、酒犒勞軍隊。[50] 孫策慰勞犒賞將士，調派部下陳寶到阜陵驅逐母親和弟弟。又公佈文告，奉告部屬各縣：“劉繇、笮融的村夫和部下來投降的，一概未幾問其他；情願參軍的，能夠參軍，並免除百口賦稅徭役；如果不肯參軍，毫不勉強。”文告密佈後，來歸附者從四周八方趕來，不長時候，就招得兵士兩萬多，征得馬匹一千多。自此，孫策之名威震江東。[51]