明帝覽疏，頗加打動，特下群臣議決。郗鑒謂：“君臣有義，義在死節，不該偷生。王敦佐吏，雖多被脅，但進不能諫止逆謀，退不能脫身遠引，有虧臣道，宜加義責。”彆的或從嶠議，或如鑒言，論久未決。還是明帝成心行仁，終從嶠請，因而敦黨皆免連坐。張茂妻陸氏，詣闕上書，語多哀思，大要上是為茂賠罪，說他不能克敵，自致陣亡，實際上是為茂請封，不過說是“略跡原心，應待恩恤”等語。明帝乃贈茂太仆，且撥庫帑，憮恤遺孥。陸氏始謝恩歸家。也算一個奇婦人。即而再敘前勳，命王導為太保，兼領司徒，西陽王羕領太尉，應詹為江州刺史，劉遐為徐州刺史，蘇峻為曆陽內史，庾亮加護軍將軍，溫嶠加前將軍，惟導固辭不受。江州本由王彬鎮守，驟遭易任，吏民未安。嗣經詹加意懷柔，才得翕服。

晉廷因叛黨悉平，當然戒嚴。有司發掘王敦屍首，焚去衣冠，扶屍跪著，梟去首級，與沈充首同懸高橋。郗鑒入奏明帝道：“前朝誅楊駿等人，皆先加官刑，後聽私殯。臣覺得逆敦既伏王誅，無妨使全私義，可聽敦家收葬，借示皇恩。”明帝準如所請，乃將敦首取下，聽令葬埋。敦黨周撫鄧嶽，相偕出亡。撫弟光擬給兄路資，陰圖執嶽。撫怒道：“我與鄧伯山同亡，如欲害鄧，寧先殺我。”伯山即嶽表字，俄而嶽至，撫即趨出，遙與嶽語道：“快去！快去！我弟尚不相容，何論彆人。”嶽回身返走。撫亦獲得資斧，追及鄧嶽，同竄入西陽蠻中。厥後再經大赦，才得東還。

明帝本已出屯南皇堂，聞叛黨儘走，乃還宮大赦，惟敦黨不在赦例。申命庾亮督同蘇峻等軍，往追沈充。溫嶠督同劉遐等，往追王含錢鳳。含奔回姑孰，擬挈王應同奔荊州。應謂不如投依江州。含皺眉道：“大將軍生前，與江州屢有齟齬，何如往依？”應對道：“正為江州常日異趨，以是宜往。彼時大將軍兵馬強大，江州尚不肯阿附，識見高出凡人，今見我困阨，必定相憐，不致侵犯。若荊州守文拘束，怎能不測行事呢？”王應雖少智過乃父，但天道惡淫，豈容豎子漏網？含不肯依言，竟與應載一扁舟，往奔荊州。荊州刺史王舒，遣兵出迎。俟含父子入城，立命拿下，縛停止足，投諸江中，目睹是葬身魚腹了。江州刺史王彬，卻密具舟楫，靜待王含父子，日久不至，料知竄死，卻引為己恨。王含為逆，何足深惜，彬亦未知大抵。錢鳳走至闔廬洲，為周光所殺，函首詣闕，自贖前愆。沈充奔回吳興，聞故吳內史張茂妻陸氏，招茂舊部，在途中等待充至，將執充臠割，為夫複仇。茂為充所殺，見三十五回。充不敢竟歸，繞道奔竄，竟致迷途，誤入故將周儒家。儒誘充入複壁中，因笑語充道：“我本日得三千戶侯了。”充始知為儒所賺，乃流涕與語道：“汝能顧義活我，我必厚報，若為利殺我，我死必令汝滅族，不要悔怨。”儒竟殺充，傳首建康。充子勁，例當坐誅，為村夫錢舉所匿，幸得免死。厥後勁竟滅周氏，如充所言。充為叛賊，顧能作厲鬼耶？

那兗州刺史劉遐，臨淮太守蘇峻，已各率精兵萬人，同來勤王。明帝連夜召見，慰勞有加，並出庫帛分賜將士，眾皆主動。沈充錢鳳，欲因北軍初到，迎頭進擊，乃自竹格渚渡淮，直前攻撲。護軍將軍應詹，建威將軍趙胤等，拒戰得勝，退至宣陽門。充與鳳乘勝進逼，拔柵將戰，不料劉遐蘇峻，從東塘橫擊過來，把充鳳兩軍沖斷，再加應詹趙胤，也來助戰，殺得充鳳大敗虧輸，奪路飛奔，還逾淮水，人不及濟，前麵追兵大至。叛眾紛繁投水，溺斃至三千人。劉遐尾追不捨，行至青溪，又奮擊沈充一陣，充狼狽走脫。