皇祐五年（1053年）正月，韓琦以武康軍節度使徙知幷州（今山西太原）。當時在河東路擔負走馬接受的寺人廖浩然，為人貪恣，仗勢犯警。韓琦上奏，請朝廷將其召回，如不調走，必依法嚴懲。仁宗隻好令廖回京，並行之以鞭刑。幷州所轄地區與契丹交界，鄰邊的天池廟（今山西寧武西南）、陽武寨（今山西原平西北陽武村）等地，被契丹冒占，韓琦派人與契丹頭領據理談判，收回了這些處所，並立石為界。宋初大將潘美鎮守河東時，為了製止契丹南下劫奪，號令沿邊百姓遷徙本地，導致邊塞大片耕地荒廢不耕。慶曆四年歐陽修奉使河東時，就曾建議消弭代州（今山西代縣）、寧化軍（今山西寧武西南寧化堡）、岢嵐軍（今山西岢嵐）、火山軍（今山西河曲南）沿邊之地禁耕令，以減產糧食，供應邊防軍需，卻為軍帥明鎬所阻。十餘年後，韓琦於至和二年（1055年）春再次建議，才得以實施，開墾地步9600頃。至和二年仲春，韓琦以疾自請改知相州。在故鄉，製作晝錦堂於州署後園。嘉祐元年（1056年）七月，韓琦被派遣為三司使。八月，拜樞密使。三年六月，韓琦拜同中書門下平章事、集賢殿大學士。六年閏八月，遷昭文館大學士、監修國史。