蔣介石下野後，吳國楨隨蔣四周行動，作為他的幕僚，出運營策，並在一九四九年八月一日建立的〖中〗國百姓黨總裁辦公室內任職，但吳國楨亦特彆對台灣政治有所行動，此亦種下了陳誠對吳國楨不滿的遠因。一九四九年十仲春七日，百姓當局遷往台北。十仲春十五日，蔣中正任命吳國楨代替陳誠擔負台灣的省〖主〗席兼保安司令、行政院政務委員，以操縱吳國楨“〖民〗主先生”的形象“儘力圖奪美援”

吳國楨打仗〖中〗國交際事件始於其返國不久，他曾任交際部江蘇特派談判員公署秘書兼寒暄科長、交際部第一司副司長兼條約委員會委員等職，開端堆集了處置交際事情的經曆。一九四二年十仲春，在我國已與英美等國締盟共同抵擋日德意法西斯交際活動非常頻繁之際，吳國楨被任命為百姓當局交際部政務次長，兼任蔣介石侍從室秘書。當時，交際部長宋子文常駐美國，吳國楨負擔幫手宋子文掌理戰時交際的重擔，曾一度對外暫代部務。其間，他參與主持了中美、中英新約簽訂、籌組結合國、爭奪國際軍事政治援助等一係列首要的交際活動，插手了歡迎美國副總統華萊士拜候〖中〗國等嚴峻交際代待任務並賣力措置交際部平常的交際活動，見證了戰時〖中〗國爭奪美英支撐和大國職位的交際活動。一九四五年八月，吳國楨受命以百姓當局交際部次長身份與法國臨時當局駐華使館代庖戴立堂在重慶簽訂《收回廣州灣法國租借地專約》，宣佈了法國強租廣州灣汗青的閉幕。

吳國楨擔負台灣的省〖主〗席期間，努力於鞭策台灣人處所自治、農業鼎新，答應某些處所官員職位由普選產生，並試圖減少濫用警權。但是在抗美援朝發作後，美國改成儘力支撐百姓當局並賜與美援，吳國楨的職位也是以降落，與蔣經國與彭孟緝的間諜體係也不竭產生牴觸。台灣洋火公司總經理王哲甫無辜被捕，吳國楨命令放人。台灣保安副司令彭孟緝履行蔣經國號令，堅不放人，先判極刑：因為吳國楨的反對，經蔣介石出麵，改判七年徒刑。吳國楨已完整冇法再與蔣經國同事，蔣中正曾派黃伯度傳話，許以行政院長之職，要吳國楨好好與蔣經國合作，願當院長兼省〖主〗席亦可。但吳國楨一概回絕偕妻上日月潭，聲言非辭職照準不下山。一九五二年重生節，吳國楨由日月潭下山，在台中“無錫飯店”用餐飯畢下樓，見包姓司機神采慘白；吳國楨的座車前輪與主軸連接的處所，疑似螺絲鬆動，幾遭不測。一九五三年四月，吳國楨辭省〖主〗席職，蔣介石任命俞鴻鈞代替吳國楨。

一九三八年十月日軍攻占漢口，吳國楨百口逃往重慶。一九三九年，吳國楨出任重慶的市長。一九四二年，重慶大隨道慘案產生，吳國楨被奪職。一九四三年，吳國楨出任交際部政務次長，一九四五年出任〖中〗國百姓黨〖中〗央鼓吹部長。在〖中〗國近當代汗青上，吳國楨是唯一前後擔負過〖中〗國四大省市長官的人物。一九三三年吳國楨任漢口的市長經心市政扶植，曾主持修建沿江大堤和沿江大道，戰時複為保衛大武漢，作出主動進獻。一九三九年吳國楨又任戰時陪都重慶的市長，