第八章:
7:水解啟用,天然過渡態近似物在分泌胰蛋白酶的細胞內製止胰蛋白酶的提早啟用和serpin作為按捺蛋白對它的按捺。
4:肯定靠近多肽底物連絡位點的氨基酸殘基性子,看有無催化三元體的存在;測定一級佈局,和已知的絲氨酸蛋白酶停止比對,考查同源性;停止一係列ph竄改的動力學嘗試,以肯定關頭氨基酸殘基的pka;利用絲氨酸蛋白酶特同性按捺劑和過渡態近似物按捺劑;還能夠利用親和標記,化學潤色和定點突變等嘗試。
6.9:按照暗碼子和反暗碼子配對遵循反平行原則以及寫堿基序列要遵循從5到3的方向,彆的ψ為假尿苷,與a配對,不可貴出gψc辨認的暗碼子序列應當是gac。
3:野生分解或者用體外轉錄的體例獲得核糖核酸酶p中的rna,如答應以製止蛋白質的淨化,再看其有冇有催化活性。
4:按照rna天下的假說,應當起首尋覓這個星球上有無rna。
4:不成逆性按捺使酶有效濃度降落而導致vmax的降落,但並不影響酶與底物的親和力,既不影響km,以是其動力性特性近似於非合作性按捺。
1.3:tyr的等電點是(2.29.1)/2=5.65,cys的等電點是(2.08.4)/2=5.2
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9章:q3,4,5,8
1:還存在於統統生物體內的天然核酶有核糖核酸酶p和核糖體;還存在於統統真核生物體內的核酶有u6-snrna。
253.16:負超螺旋dna和正超螺旋dna彆離是dna兩條鏈纏繞不敷和過分纏繞引發的,而核酸酶s1專門水解單鏈核酸,故當將共價閉環負超螺旋dna與核酸酶s1保溫在一起的時候,因為負超螺旋共價閉環dna在溶液裡與含有部分化鏈的敗壞型dna之間存在均衡,核酸酶s1將水解敗壞型dna上產生解鏈的單鏈部分,產生缺口,並進一步促使均衡向敗壞型傾斜,顛末一段時候後,統統的負超螺旋dna都竄改成線形的雙鏈dna。但是正超螺旋dna不會構成帶有單鏈地區的敗壞型dna,故它的佈局穩定。
1.4:如果選用陰離子互換層析,asp,lys和ala在ph6的低鹽緩衝溶液下上柱,那麼帶負電荷的asp將被吸附在樹脂上,而帶正電荷的lys和淨電荷為零的ala將直接呈現在流出液中,asp會在隨後的高鹽緩衝溶液洗脫中獲得,如許就實現了asp與lys和ala的分離。如果還需求將lys和ala分開,能夠將彙集到的直接流出液再停止陽離子互換層析。
10章:q4,6,7
2.11:第一應當是無益於構成a-螺旋的氨基酸;第二側鏈應當是含有氫鍵供體或受體的氨基酸,如許無益於通過氫鍵去辨認並連絡特定的堿基序列;第三最好側鏈帶正電荷或不帶負電荷,如許無益於和磷酸骨架的連絡。合適這幾個前提的氨基酸有lys,arg,gln,asn和tyr。
2:his側鏈的pka靠近心機ph,使其很輕易作為質子供體或受體而參與酶化。
8章:quiz2
8:h越大,正協同性就越強,彆構啟用劑的感化使得反應體係中更多的酶變成了r態,不再需求底物的啟用,是以彆構啟用劑的存在可導致彆構酶正協同性的降落,而彆構按捺劑恰好相反,是以彆構啟用劑減少h,彆構按捺劑提□□。