湖州府學官又擔擱了二十幾天，才移文歸安縣和烏程縣的學官，要他二人申覆。那兩個學官也早獲得莊允城的大筆賄賂，當時新版明史也已印就，二人將兩部新版書繳了上去，回稟：“該書平淡細緻，無裨世道民氣，然細查全書，尚無諱禁犯例之處。”層層申覆，就此不了了之。

吳之榮直到在書鋪中發明瞭新版明史，方知就裡，心想唯有弄到一部原版明史，才氣重揭此案。杭州各家書鋪當中，原版書早給農戶買清，當下前赴浙東偏僻州縣蒐購，豈知仍然一部也覓不到。他窮愁得誌，隻得廢然回籍。也是事有剛巧，旅途當中，卻在一家客店中見到店東人正在點頭晃腦的讀書，一看之下，所讀的便是這部《明書輯略》，借來一翻，竟是原版。這一下大喜過望，心想若向客店東人求購，一來他一定肯售，二來手頭銀錢無多，買不起，隻好偷。深夜當中悄悄起床，偷了書便即溜出店門，心想浙江全省有關官員都已受了莊允城之賄，一不做，二不休，乾脆告到北都城去。

書僮將查伊璜扶入內堂安睡，那乞丐自行又到屋簷之下。次晨查伊璜醒轉，忙去瞧那乞丐時，隻見他負手而立，正在賞識雪景。一陣北風吹來，查伊璜隻覺寒入骨髓，那乞丐卻泰然自如。查伊璜道：“天寒地凍，兄台衣衫未免過於薄弱。”當即解下身上的羊皮袍子，披在他肩頭，又取了十兩銀子，雙手捧上，說道：“些些買酒之資，兄台勿卻。何時有興，請再來喝酒。昨晚兄弟醉倒，未能掃榻留賓，簡慢勿怪。”那乞丐接過銀子，說道：“好說。”也不伸謝，揚長而去。

到得杭州後，自運河折而向北，這晚在杭州城外聽到動靜，清廷已是以案而處決了很多官員百姓：莊廷鑨已死，開棺戮屍；莊允城在獄中不堪虐待而死；農戶百口數十口，十五歲以上的儘數處斬，妻女發配瀋陽，給滿洲旗兵為奴。前禮部侍郎李令皙為該書作序，淩遲正法，四子處斬。李令皙的季子剛滿十六歲，法司見殺得人多，心腸軟了，命他減供一歲，遵循清律，十五歲以下者得免死放逐。那少年道：“我爹爹哥哥都死了，我也不肯獨生。”終究不肯易供，一併處斬。鬆魁、朱昌祚入獄候審，幕客程維藩淩遲棄市。歸安、烏程的兩名學官處斬。是以案連累，冤枉而死的人亦不計其數。湖州府知府譚希閔到任還隻半月，朝廷說他知情不報，納賄藏匿，和推官李煥、訓導王兆禎同處絞刑。

第二年春季，查伊璜到杭州玩耍。一日在一座破廟當中，見到有口極大的古鐘，少說也有四百來斤，他正在觀賞鐘上所刻的筆墨斑紋，忽有一名乞丐大踏步走進佛殿，左手抓住鐘鈕，向上一提，一口大鐘竟然離地數尺。那乞丐在鐘下取出一大碗肉、一大缽酒來，放在一旁，再將古鐘置於原處。查伊璜見他如此神力，不由駭然，細心看時，竟然便是去冬一起喝酒的那乞丐，笑問：“兄台還認得我嗎？”那乞丐向他望了一眼，笑道：“啊，本來是你。本日我來作東，大師再喝個痛快，來來來，喝酒。”說著將土缽遞了疇昔。

至於江南名流，因莊廷鑨慕其大名、在書中列名參校者，同日淩遲正法，計有茅元錫等十四人。所謂淩遲正法，乃是一刀一刀，將其滿身肢體肌肉漸漸切割下來，直至犯人受儘痛苦，方纔正法。因這一部書而家破人亡的，當真難以計數。