初四日，袁崇煥犒賞毛部兵將共三千五百七十五名，軍官每名銀子三五兩不等，兵每名數錢，又將帶來的餉銀十萬兩交卸。同時和毛分彆權柄，而後旅順以東由毛批示，旅順以西由袁批示。毛文龍收到大筆銀子，對批示權的區劃又非常對勁，減少了防備警戒。

六月月朔，毛文龍帶領部下達到島山，與袁相互交拜。毛文龍呈上禮帖三封和三桌筵席。在船中吃過，袁崇煥和他說話，說道：“遼東外洋，隻要我和貴鎮二人，務必同心共濟，方能勝利。我曆險來此，旨在商討進取。軍國大事，在此一舉。我有一個良方，隻不知抱病的人肯不肯服這一帖藥。”當晚兩人直談到二更。初二袁崇煥上島，犒賞毛的部下，和毛又密談到半夜。初三日又再談，袁崇煥要求皮島設文官監軍，糧餉由寧遠轉發，改編軍隊，連談三日三夜，毛文龍始終分歧意，到這時構和終究分裂。袁崇煥給他最後一個機遇，勸他辭職回籍，享用西湖風景。毛文龍說：“辭職回籍這件事，我一向是在盼望的。隻不過我對遼東事件很熟諳，處理了滿洲以後，可順勢剿襲朝鮮了。”袁崇煥聽他大言不慚，更是不滿。[91]酒散後，袁傳副將汪翥上船密議，五更方畢。徹夜擺設，要殺毛文龍了。

崇禎接位後，毛文龍風格不改。朝廷感覺皮島破鈔糧餉太多（因毛文龍要的是十萬名官兵的糧餉），要派人去核數查帳。毛文龍多方推托，總之是不歡迎禦用管帳師駕臨。

皮島在鴨綠江口之東，與朝鮮本土隻一水之隔，水麵間隔隻不過相稱於過一條長江罷了，北岸便是朝鮮的宣川、鐵山。[88]當時朝鮮的義州、安州、鐵山一帶，因為鄰近中國，從遼東逃出來的漢人災黎和敗兵紛繁湧到，喧賓奪主，漢人占了住民非常之七，朝鮮人隻非常之三。皮島橫約八十裡，逃到島上的漢報酬數很多。毛文龍作為按照地後，再招納漢人，陣容漸盛。明朝特彆為他設立一個軍區，叫作東江鎮，升毛文龍為總兵。

袁崇煥問毛的部將：“毛文龍該斬麼？”諸將都嚇得不敢出聲。有人說毛文龍這些年來雖無功績，但也辛苦著力。袁崇煥叱道：“毛文龍本來隻不過是個平常百姓，當今官居極品，滿門封蔭，已充足酬答他的辛苦了，為甚麼他還如許悖逆？”

袁崇煥除座船外，帶船三十八艘，解纜前先試放西洋大炮，射程遠的五六裡，近的三四裡。廿六日到雙島，登州的軍官帶了兵船四十八艘來會。廿七日到島山停靠，旅順的軍官前來拜見。袁崇煥帶眾將上山，到龍王廟去拜龍王，對眾將訓話：“本朝建國，中山王徐達、開平王常遇春諸將開初在鄱陽湖、采石磯大戰，厥後一向打到漠北，水戰當然勝，馬步戰也勝，才氣擯除胡元，同一中國。現在你們的海軍隻能以紅船在水上自守，滿清韃子不下海，莫非能趕他們入海打水戰麼？以是海軍必須也能陸戰。”他的抱負是要將海軍練習成為水兵陸戰隊。

袁崇煥隨即提出幾件事來責問毛文龍，毛文龍抗辯。袁崇煥不客氣了，斥責道：“本部院披肝瀝膽，與你說了三日，隻道你轉頭是岸，也還不遲。那曉得你狼子野心，老是一片欺誑到底。你目中冇有本部院，那也罷了。方今聖天子威武天縱，國法豈容得你？”命人除下他衣冠，綁了起來。毛文龍的態度仍非常倔強，自稱無罪有功。