光武擔當了西漢期間獨尊儒術的傳統，東漢建立後，即興建太學，設置博士，各以家法傳授諸經。光武巡幸魯地時，曾遣大司空祭奠孔子，厥後又封孔子後嗣孔誌為褒成侯，用以表示尊孔崇儒。特彆是對儒家今文學派製造的讖緯科學更是崇拜備至。早在東漢建立之初，光武就仿照王莽、公孫述等人操縱讖書作為其接受天命的根據，教唆他疇昔的同窗強華捏造了一個叫做“赤伏符”的讖語“劉秀出兵捕不道，四夷雲集龍在野，四七之際火為主”，表示他擔當了西漢的火德，是“被騙六合之心，下為元元所歸”的真命天子。東漢同一天下後，更“宣佈圖讖於天下”，把讖緯科學尊為“內學”，作為其保護封建統治的思惟東西。在倡導儒學神學的同時，光武鑒於西漢末年一些官僚、名流醉心利祿，憑藉王莽，乃表揚時令，對於王莽代漢期間隱居不仕的官僚、名流加以表揚、禮聘，表揚他們忠於漢室、不仕二姓的“高風亮節”，詭計養成重名節的社會民風，為穩固東漢封建統治辦事。

光武以虐待功臣貴戚為名，賜以爵位田宅、高官厚祿，而摘除其軍政大權。光武鑒於西漢前期三公權重、權益下移，雖設三公之位，而把統統行政大權歸之於設在中朝由天子直接批示的尚書檯。尚書檯設尚書令一人，秩千石；尚書仆射一人，六曹尚書各一人，秩皆為六百石，分掌各項政務。以下設有丞、郎、令史等官，統統統統政令都由尚書檯直接稟陳天子，由天子訊斷。今後，“天下事皆上尚書，與人主參決，乃下三（公）府”；“雖置三公，事歸台閣”，“三公之職，備員罷了”。但是到了東漢前期，有權勢的大臣多加“錄尚書事”的職銜，從而權益再度下移，尚書檯又演變成權臣專政的東西。

光武帝統治期間，東漢的農業、手產業都獲得了大大生長。鐵製耕具的改進、牛耕的提高、水利工程的遍及修建，使出產技術大大進步；冶鐵技術的改進，使鐵的產量大為增加；精彩的銅器、漆器、絲織品反應出高超的手產業工藝；通都大邑