卡卡西小組收到任務，庇護造橋專家達茲納回到波之國。但在任務途中，他們遭到霧忍者村的叛忍桃地再不斬的進犯，這也成為了他們的第一次實戰。世人在戰役中各自都有所生長，也體味到了忍者天下的殘暴性。

疾風傳

大蛇丸找到綱手，但願她能醫治本身的雙手，並提出能夠讓她再次見到她最正視的兩人的前提。綱手為此躊躇不決，這時鳴人和自來也找到了她。綱手對繼任火影一事心灰意冷，但她看到鳴報酬了成為火影的胡想而刻苦修行的模樣，也逐步竄改了設法。以後綱手回絕了大蛇丸的要求，昔日的三忍展開狠惡的戰役，鳴人也終究練成了自來也所傳授的螺旋丸，打敗了大蛇丸的侍從兜。最後大蛇丸被逼退，綱手跟從自來也和鳴人回到木葉，成為第五代火影。

此時佐助以為本身已經獲得了超出大蛇丸的力量而俄然向大蛇丸發難，破解了他的轉生忍術，打倒了大蛇丸。佐助找到了大蛇丸本來的部下水月、香磷和重吾，四人構成名為“蛇”的小隊，為了尋覓鼬而展開行動。在此期間，佐助與“曉”的迪達拉遭受並交兵，迪達拉敗於佐助部下，為了證明本身的藝術而自爆，佐助卻躲在了萬蛇的體內而躲過一劫。迪達拉

木葉忍者村因為大蛇丸的詭計而遭到極大的毀傷，就在此時，已經叛離木葉的宇智波鼬俄然現身。鼬是佐助的哥哥，曾經將一族的人們全數殺光而分開村莊，此次他與霧忍者村的乾柿鬼鮫一同來到木葉，彷彿是以鳴人體內的九尾作為目標，並且是遭到名為“曉”的構造的號令。佐助得知鼬回到村莊，向鼬建議應戰，但卻遭到慘敗。而後，自來也為了尋覓新任火影的候補人選綱手，同時也為了幫忙鳴人修行，而和鳴人一起外出尋覓綱手的下落。

正在加載火影忍者

卡卡西因為勞累過分而住院，暗部的大和代替卡卡西帶領卡卡西小組，新的成員佐井也插手了步隊。他們操縱從蠍那邊獲得的諜報，前去六合橋探聽有關佐助的動靜。但佐井實際上倒是奉下屬團藏的號令履行暗害佐助的極秘任務，本籌算履行任務的他在看到鳴人與佐助的拘束以後竄改了設法。鳴人等人終究在大蛇丸的按照地與佐助相逢，但佐助仍然不籌算轉意轉意，還是挑選和大蛇丸一起分開。而佐井則因為這一任務的契機成為了鳴人他們的火伴。

在外修行了兩年半的鳴人返來了。但此時的“曉”也開端蠢蠢欲動，已經成為砂忍者村風影的我愛羅被“曉”成員迪達拉和蠍擄走。鳴人和卡卡西小組為了救出我愛羅而前去砂忍者村，並找出了“曉”的按照地，但我愛羅已經被抽離尾獸而滅亡。氣憤的鳴人不顧統統地追逐迪達拉，而小櫻和砂忍者村的千代婆婆聯手與蠍交兵，終究將蠍打倒。千代婆婆捐軀本身的生命，利用轉生忍術將我愛羅重生，鳴人他們回到木葉忍者村。

鳴人他們完成任務回到村莊，卡卡西保舉他們插手即將停止的中忍測驗。測驗會場中強手雲集，而在測驗過程中，鳴人他們遭到原屬木葉忍者村、已經叛離村莊的大蛇丸的進犯，佐助也被大蛇丸在身上留下了咒印。以後，鳴人和佐助順利通過預選賽，併爲即將到來的正式測驗作籌辦。鳴人獲得木葉三忍之一的自來也傳授忍術，而佐助則是遭到卡卡西的專門指導。但與此同時，大蛇丸正在公開裡醞釀著詭計，那就是結合砂忍者村一同攻擊木葉。