袁崇煥當然死力反對，對高第說：“兵法有進無退。諸城既已光複，怎可隨便撤退？錦州、右屯衛一擺盪，寧前就震驚，山海關也失了保障。這些外衛城池隻要派良將守禦，必然不會有傷害的。”高第不聽，命令寧遠、前屯衛也撤兵。

天啟三年玄月，袁崇煥達到寧遠。

但是好景不常，時勢垂垂變壞。天啟天子熹宗越來越喜好做木工。魏忠賢的權力越來越大，儘量闡揚他地痞地痞脾氣中的惡棍、無知、無恥、以及冇法無天。

寧遠現在叫作興城，有鐵路顛末，是錦州與山海關之間的中間站。地濱連山灣，與葫蘆島相距甚近。我真盼望將來總有一日能到興城去住幾天，好好的看看這個處所。

當時袁崇煥仍死力主張築城寧遠。朝廷中的大臣都反對，以為寧遠太遠，守不住。大學士孫承宗是個有見地之人，親身出關巡查，體味詳細環境，接管了袁崇煥的觀點。

袁崇煥一再向下屬提出這個關頭題目。王在晉是萬曆二十年進士、江蘇太倉人的文弱墨客（姑蘇的白麪墨客），底子不懂軍事，目光短淺，膽量又小，聽袁崇煥說要在關外守關，想想事理倒也是對的，便主張在山海關外八裡的八裡鋪築城守禦。他必然想，離山海關太遠，逃不返來，那如何得了？袁崇煥以為隻守八裡的地盤冇有效，核心陣地太窄，起不了樊籬山海關的感化，和王在晉爭辯，王不采取他的定見。因而袁崇煥去處首輔葉向高申請，葉也不睬。

短短三四年之間，從京師戒嚴到東巡廣寧，軍事從守勢轉為守勢，這主如果孫承宗主持之功，而袁崇煥也進獻了很多方略。

熊廷弼在遼東立有大功，蒙冤入獄，百姓都很憐憫他。官方傳播一部繡像演義小說《遼東傳》，描述熊廷弼守遼東的英勇事蹟。魏忠賢的徒黨中有一個名叫馮銓的，他父親當年在遼東作佈政的官，清兵未到，先就鼠竄南逃。《遼東傳》第四十八回有“馮佈政父子奔逃”一節，描述馮銓父子棄職而逃的狼狽醜態，可說是當時的“訊息體小說”。

他到山海關後，作為遼東經略（東北軍區總司令）王在晉的部屬，初時在關內辦事。王在晉見他任事精乾，非常倚重，派他出關到前屯衛去收撫流浪失所的災黎。袁崇煥受命以後，當夜解纜，在波折豺狼當中夜行，四更天時達到。前屯城中將士無不平氣。袁崇煥本是墨客，這一來，兵將都服了他了。

不久孫承宗代王在晉作遼東主帥。天啟二年玄月，孫承宗派袁崇煥與副將滿桂帶兵駐守寧遠，這是袁崇煥領軍的開端。

天啟四年，袁崇煥與大將馬世龍、王世欽等帶領一萬二千名馬隊步兵東巡廣寧。廣寧即今北鎮縣，在錦州之北，與滿清重鎮瀋陽已漸漸靠近了。袁崇煥還冇有和清兵交過手，此次已含有主動應戰的意味。但清兵冇有應戰。袁崇煥一軍通過大淩河的出口十三山，從海道還寧遠。這時清兵已退出十三山。