神農氏的另一巨大功勞就是初創了中國醫藥和醫術。

傳言神農乃小巧貴體。能見其肺好五臟，因能化解藥毒。又傳說神農因嘗百足蟲，不能解其毒而致死。傳說神農氏樣貌很獨特，身材肥胖，身材除四肢和腦袋外，都是透明的，是以內臟清楚可見。神農氏嚐盡百草，隻要藥草是有毒的，服下後他的內臟就會閃現玄色，是以甚麼藥草對於人體哪一個部位有影響便能夠等閒地曉得了。並以此傳授人們人類最早的著作《神農本草經》，開端隻是口耳相傳，到了漢朝方為人們用筆墨記錄下來，實在已經顛末端半途人們的不竭補充。厥後，因為神農氏服太多種毒藥，積毒太深，終究身亡。

《白虎通》："古之群眾皆食禽獸肉，至於神農，人公浩繁，禽獸不敷，因而神農因天之時，分地之利，製耒耜，教民農作，神而化之，使民宜之，故謂之神農也。"

出產力的進步，令人們的餬口相對穩定下來，人們不再為了餬口四周遷徙，開端了安居樂業的餬口，這動員了社會文明的生長。《齊俗訓》雲："神農之法曰：丈夫丁壯不耕，天下有受其饑者；婦人當年而不織，天下有受其寒者。故身自耕，妻親織，覺得天下先其導。……奸邪不生，安樂無事而天下均平。"這反應了當時社會天下為公、連合和睦和群眾安居樂業的氣象。當時已呈現“身親耕，妻親織”的家庭情勢，這又是父係氏族社會產生的標記。當時已經開端從母係氏族社會向父係氏族社會的竄改，且在婚姻軌製上有了締結和嫁娶之禮，使家庭在原始社會中的感化更加較著，人們對家庭的品德實際有了開端的熟諳。

《綱鑒易知錄》記錄：“民有疾，未知藥石，炎帝始草木之滋，察其寒、溫、平、熱之性，辨其君、臣、佐、使之義，嘗一日而遇七十毒，神而化之，遂作文書上以療民疾而醫道自此始矣。”《史記・補三皇本紀》謂：神農氏作蠟祭，以赭鞭鞭草木，嘗百草，始有醫藥。《淮南子・修務訓》亦謂：神農嘗百草之滋味，一日而遇七十毒。晉乾寶《搜神記》卷一：“神農以赭鞭鞭百草，儘知其平毒寒溫之性，臭味所主，以播百穀。”